La vita non è più possibile sulla Terra e grandi satelliti artificiali chiamati orbitanti vicini sono stati creati per essere abitati. Per cercare di sopravvivere, l'umanità dà inizio a un'aggressiva campagna di colonizzazione nella galassia. Gli orbitanti-vicini si alleano per difendersi e creano N.O.V.A., l'avanguardia dell'alleanza orbita-vicina.

Adesso, però, dalle profondità dello spazio giunge una strana minaccia. Una nave dei marines data per dispersa una settimana prima ricompare all'improvviso e si dirige verso gli orbitanti-vicini, ignorando tutte le comunicazioni.

Contro la sua volontà, l'ex eroe dei Marines Kal Wardin viene costretto a rientrare in servizio con N.O.V.A. per infiltrarsi nella nave. Ma né Kal né N.O.V.A. possono immaginare la pericolosità di ciò che si cela a bordo e che costringerà Karl a lottare per impedire lo sterminio del genere umano.