La vie sur Terre étant devenue impossible, de gigantesques satellites artificiels dits orbitaux furent construits pour accueillir les humains. Afin de lutter pour sa survie, l'humanité entama une colonisation agressive de la galaxie. Pour se protéger, les habitants de ces orbitaux s'unirent pour former la N.O.V.A, l'Alliance Avant-Garde Orbitale.

Mais aujourd'hui, une étrange menace a émergé du fin fond de l'espace. Un vaisseau Marine, porté disparu une semaine plus tôt, est subitement réapparu et se dirige vers les orbitaux, ignorant toutes les communications.

Bien malgré lui, l'ex-Marine Kal Wardlin doit reprendre du service auprès de la N.O.V.A. et infiltrer le vaisseau. Mais ni Kal ni la N.O.V.A. n'auraient pu imaginer l'ampleur de ce qui se cachait à l'intérieur, ni jusqu'où Kal devrait aller pour empêcher l'extermination de la race humaine.